为了使冻干机正常工作，应该使用冷却系统。其中，冷水机组是常用的冻干及配套设备。冷水机组是一种水冷系统设备。水通过冷水机组冷却，然后低温冷冻水通过循环系统注入设备冷却。冷冻水带走机器内部的热量，高温热水流回水箱冷却，如此循环交换冷却，达到冷却设备的作用。
冷冻设备是车间使用的真正的空冻干设备，正常使用要求在5~30℃、30~70%湿度下工作。冷冻机设备系统在运行过程中会产生一定的热量。设备工作环境中热量的积累会造成环境温度过高，影响机组的运行。需要有一个冷却系统来直接从环境或配套的冷却设备中带走设备的热量。冻干机行业的应用实践是大型冻干机采用冷却塔冷却，中小型冻干机配备冷水机组。根据冷冻干燥机产生的热量，选择相应的冷水机组进行冷却。冷水机组配套冻干机的特点是安装对接方便，节省空空间。
冷水机组广泛用于与冻干机配套，主要是因为其安装操作简单，制冷效果好，运行稳定，节省空时间。LS冷水机组包括实验室冷水机组和工业冷水机组，广泛应用于实验室和工业。
